Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GINS3Q9BRX5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms