Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
RETNLBQ9BQ08 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms