Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOL4Q9BPW4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms