Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SLC38A2Q96QD8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms