Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMG1Q96Q15 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SMG1Q96Q15 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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