Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EAF1Q96JC9 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EAF1Q96JC9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms