Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BORCS6Q96GS4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BORCS6Q96GS4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms