Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SMARCE1Q969G3 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMARCE1Q969G3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMARCE1Q969G3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SMARCE1Q969G3 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMARCE1Q969G3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SMARCE1Q969G3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms