Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM171Q8WVE6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM171Q8WVE6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms