Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

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Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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ZNF398Q8TD17 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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ZNF398Q8TD17 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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ZNF398Q8TD17 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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ZNF398Q8TD17 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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ZNF398Q8TD17 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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ZNF398Q8TD17 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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ZNF398Q8TD17 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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ZNF398Q8TD17 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ZNF398Q8TD17 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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