Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC63Q8NA47 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms