Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
LINC00612Q8N6U2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms