Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCSAMQ8N6F7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms