Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM20Q8N5G0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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