Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC82Q8N4S0 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms