Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYNE4Q8N205 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYNE4Q8N205 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms