Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TRAPPC6BQ86SZ2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
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TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRAPPC6BQ86SZ2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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TRAPPC6BQ86SZ2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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