Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CATSPER4Q7RTX7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CATSPER4Q7RTX7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms