Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BBS12Q6ZW61 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms