Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PAXIP1Q6ZW49 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms