Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SYDE1Q6ZW31 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SYDE1Q6ZW31 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms