Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVM7

TOM1L2, TOM1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1L2Q6ZVM7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TOM1L2Q6ZVM7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms