Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC129Q6ZRS4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms