Protein–RNA interactions for Protein: Q6YHK3

CD109, CD109 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD109Q6YHK3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CD109Q6YHK3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms