Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LRIG3Q6UXM1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LRIG3Q6UXM1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms