Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC4A10Q6U841 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC4A10Q6U841 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms