Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Q6Q795 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q6Q795 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Q6Q795 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Q6Q795 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms