Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TMEM225Q6GV28 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms