Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATL3Q6DD88 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms