Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SHEQ5VZ18 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms