Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
FAM78BQ5VT40 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAM78BQ5VT40 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAM78BQ5VT40 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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FAM78BQ5VT40 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM78BQ5VT40 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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