Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 GPR176-201ENST00000299092 3844 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
OBSCNQ5VST9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms