Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NUP188Q5SRE5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NUP188Q5SRE5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms