Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGS0

NEXMIF, Neurite extension and migration factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXMIFQ5QGS0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEXMIFQ5QGS0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEXMIFQ5QGS0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEXMIFQ5QGS0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEXMIFQ5QGS0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEXMIFQ5QGS0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEXMIFQ5QGS0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEXMIFQ5QGS0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEXMIFQ5QGS0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEXMIFQ5QGS0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEXMIFQ5QGS0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEXMIFQ5QGS0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEXMIFQ5QGS0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEXMIFQ5QGS0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEXMIFQ5QGS0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEXMIFQ5QGS0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NEXMIFQ5QGS0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEXMIFQ5QGS0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEXMIFQ5QGS0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEXMIFQ5QGS0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NEXMIFQ5QGS0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms