Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACSM3Q53FZ2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms