Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP221Q4G0U5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP221Q4G0U5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms