Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SP6Q3SY56 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms