Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TTLL9Q3SXZ7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms