Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V8

BSX, Brain-specific homeobox protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSXQ3C1V8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BSXQ3C1V8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BSXQ3C1V8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms