Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CSPP1Q1MSJ5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms