Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GEN1Q17RS7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GEN1Q17RS7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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