Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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RTL8BQ17RB0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RTL8BQ17RB0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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RTL8BQ17RB0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RTL8BQ17RB0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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