Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IMPG1Q17R60 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IMPG1Q17R60 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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