Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
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CDO1Q16878 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CDO1Q16878 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDO1Q16878 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms