Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
NDUFA9Q16795 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
NDUFA9Q16795 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms