Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ECM1Q16610 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ECM1Q16610 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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