Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHRNA6Q15825 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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