Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHRNA2Q15822 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CHRNA2Q15822 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms