Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HMGN3Q15651 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HMGN3Q15651 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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