Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NECTIN1Q15223 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NECTIN1Q15223 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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